一种亚麻短纤维的生物处理方法，涉及一种制备亚麻短纤维的方法。现有亚麻短纤维的处理方法存在纤维受损失重、强力下降以及可纺性和染色性差的问题。一种亚麻短纤维的生物处理方法，它依次包括以下步骤：a.酶催化降解→b.热水溶解→c.萃取→d.热水溶解→e.脱水→f.柔软→g.脱水→h.烘干→i.纤维机械分裂。本发明用生物技术加工亚麻短纤维的方法，是在常压设备中，利用生物复合酶有针对性地去除大部分纤维共生物，不损伤纤维强力，提高了纤维的分裂度，增加了工艺纤维的可纺性和纺纱支数，同时增加了染料的上染率和色牢度，着色均匀。纤维柔软，其可纺性和染色性大大提高。并且本发明的方法不会造成废水污染，加工设备和操作方法都非常简单，利于推广应用。