本发明公开了一种控制再生水富营养化的沉水植物反应装置及其处理方法，所述装置为，补充光源设置在罐体中央，所述定植管设置在罐体内的补充光源四周，所述网片设置在定植管的上部两侧位置。处理方法包括(1)沉水植物反应装置与再生水池连接；(2)将沉水植物放入定植管中；(3)白天使用自然光照20000－50000lux，晚上开启补充光源2000lux，温度在20－25℃；(4)水体在所述沉水植物反应装置中停留3－5天后排出。本发明具有生态安全性好、对再生水中的营养盐去除率高，沉水植物易于收获和再利用，而且出水含有能抑制藻类生长的沉水植物次生代谢产物，回用于景观水体不易滋生藻类，景观效果好，且成本低。