本发明公开了一种菹草种苗快速繁殖的方法，首先是从自然水体或温室中采集菹草植株；其次是对采集的植株进行预处理，去除植物表面吸附物质；第三去除植物叶和根，取靠顶端的部位，在无菌条件下对其灭菌。灭菌要彻底，同时要减少对植物组织的损伤。第四对灭菌处理过的茎段进行切割，然后转接到含激素的固体培养基上进行诱导生芽。第五待芽长到一定长度时转接到增殖培养基扩增培养。第六把扩增培养的苗转接到诱导生根的培养基中诱导生根。第七当苗长出较多根后，对幼苗驯化，然后种植到自然水体中。本技术解决了菹草种苗大量供需问题，材料易于获得、过程快捷、无季节影响、成本低廉。