本发明涉及一种用抗菌强化因子改性源于海洋甲壳生物的甲壳质及其衍生物，再辅以植物通用营养素成分制备用于植物消毒的强抗菌多功能海洋生物农用制剂的制备方法，其制剂的主要成分为脱乙酰甲壳质及其衍生物、二氧化氯，辅助成分为植物营养素；先将脱乙酰甲壳质及其衍生物配制成1％～10％的弱酸性溶液或中性溶液，在搅拌条件下慢慢加入二氧化氯成分反应20～90分钟，再加入植物营养素搅拌均匀即制得海洋生物农用制剂，其制剂中固含量为0.0001％～100％。本发明实施工艺简单，原料丰富易得，产品用于范围广，抗菌消毒作用强，同时具有施肥增产的作用，可广泛用于植物叶面上的喷涂或根茎浇灌。