本发明涉及一种用于电子仪器或设备的多通道模拟信号采样方法和系统，目的在于提供一种抗干扰能力强、采集数据的稳定度和准确度高、传输速率快的模拟信号采样方法和系统。技术方案是：一种多通道模拟信号采样方法，包括：模拟信号调理、模数转换、数字信号传输、系统采样控制步骤，所述模拟信号调理步骤中，每个通道的模拟信号采用单独的电路、以平衡方式输入的差分信号形式进行传输；所述模数转换步骤中，所述模数转换步骤中，多个通道接口同时并行接收差分信号，同时进行模数转换；模数转换采用过采样方式；模数转换后的数字信号与微处理器之间采用高速串行通信方式进行数据交换；所述系统采样控制步骤中，系统初始化和程控命令传输采用串行接口方式。