本发明提供一种合并零件图档中同类孔的系统及方法，该系统包括：一图档汇入模块，用于汇入零件对应的图档；一过滤模块，用于过滤出图档中的所有零件孔并生成一零件孔集合，从零件孔集合中获取同类孔，所述的同类孔为具备相同属性的孔；一判断模块，用于判断过滤模块所获取的同类孔是否相交，还用于检查零件孔集合并判断该零件孔集合中是否还有未经合并处理的同类孔；一处理模块，用于合并相交的同类孔，包括：对相交的同类孔进行外轮廓处理以得到相交同类孔的外轮廓，提取其中一同类孔的属性，将所得的相交同类孔的外轮廓与该属性进行关联，将该外轮廓定义成有属性的零件孔。利用本发明，可对零件图档中相交的同类孔进行快速的合并处理。