本发明公开了一种码分多址通信系统中的码资源分配方法，其包括以下步骤：记录码分多址系统码树上各结点的状态为空闲或非空闲，输入待分配扩频因子；以扩频因子为4的四个结点作为根结点，将码树为四组，分别记录各组下各层剩余的码资源；根据待分配扩频因子及码树中各结点下剩余码资源的数目决定具体分配资源的分支，并在其下找到结点进行分配；更改已分配结点的状态及其所属资源组的剩余资源情况。本发明方法由于利用码分多址系统码资源的完全二叉树特点，将码资源分成几个资源分配组，有效缩小了资源搜索的范围，并降低了实现的时间复杂度；尤其在码树全部空闲的情况下实现了十分简单快捷的分配。