本发明公开了一种消除管径尺寸测量误差的影响的液体微流动双管相对测量方法及装置。该方法包括如下步骤：1)提供两个微管道a、b；2)将压力源与上述两个微管道相连；3)测量第一液体在上述两个微管道中的流量Q_a1、Q_b1；4)提供一种第二液体，其物性参数在上述两个微管道实验中保持常数；5)测量第二液体在上述两个微管道的流量Q_a2、Q_b2；6)计算表观黏性系数比ξ=(Q_a1/Q_b1)/(Q_a2/Q_b2)。该装置包括：压力源、储液罐、进液阀、压力传感器、三通接头、四通接头、两个微管道、两个流量计。本发明消除了带来主要误差的管径尺寸的几何误差影响，可以对微小流量差进行测量，提高了相对测量精度，比单管多次测量的精度更高。