本发明公开了一种无线通信系统中的闭环上行同步控制方法，包括如下步骤：基站清空寄存器S1，累加由UE的同步偏移值产生的同步偏移命令至寄存器S1，并向UE发送相应同步偏移命令，直至寄存器S1中同步偏移命令累加值的绝对值在时间段T1内小于门限A的次数大于门限N1为止；基站继续测量UE的同步偏移值，但不向UE发送相应同步偏移命令，同时将寄存器S2清零，累加同步偏移命令至寄存器S2，直至寄存器S2中同步偏移命令累加值的绝对值在时间段T2内大于门限B的次数大于门限N2为止，然后重新执行本流程。采用本方法能有效地节省系统中的传输资源，使得信道环境较稳定的无线系统具有更好的抗干扰能力和稳定性，保证了系统整体性能的提高。