本发明涉及一种扫描协议的管理系统和方法，应用于CT系统中对扫描协议进行管理，该系统包括：数据库单元，用于存储扫描协议；分组单元，与该数据库单元相连，用来对该数据库单元中的扫描协议进行分组；控制单元，分别与该数据库单元和分组单元相连，以从该数据库单元中选取一个或者复数个扫描协议，或者从该分组单元中选取一组或者复数组扫描协议，或者该一组或者复数组中的部分扫描协议来进行操作；以及人机接口单元，分别与该分组单元和控制单元相连，用来启动该分组单元和该控制单元，以及显示该分组单元和控制单元的操作结果。通过本发明扫描协议的管理系统和方法，CT系统的用户可以高效、方便、直观地管理其众多的扫描协议。