本发明公开了一种净化α－玉米赤霉醇的方法及其专用免疫亲和色谱柱。该色谱柱的填料是净化α－玉米赤霉醇的免疫亲和吸附剂，该免疫亲和吸附剂是由固相载体和与其偶联的α－玉米赤霉醇单克隆抗体组成；所述α－玉米赤霉醇单克隆抗体是以α－玉米赤霉醇与载体蛋白的偶联物为免疫原得到的；本发明的提纯方法结合色谱法高效检测α－玉米赤霉醇的含量，弥补了单纯免疫测定技术直接测定样本的信息量太少、定量准确差，或理化方法选择性低等不足，体现了免疫学技术和常规理化技术在分析机制的互补性。