本发明公开了一种岩黄连有效部位总生物碱的纯化方法，其包括将岩黄连总生物碱粗提物用酸水溶解后过滤，滤液通过大孔吸附树脂柱，先用水进行洗脱，继而用10－45％的乙醇进行洗脱，收集乙醇部分的洗脱液，浓缩，干燥即得岩黄连总生物碱。本发明还公开了该纯化方法纯化制得的岩黄连总生物碱及其防治病毒性肝炎的药物组合物。该岩黄连有效部位不仅具有较好的水溶性，而且其总生物碱含量以脱氢卡维丁计算大于52％。