本发明涉及一种将低浓度甲缩醛脱除杂质获得高纯度甲缩醛的方法，它是将含有杂质的低浓度甲缩醛经蒸馏釜汽化后进入精馏塔塔底，将脂肪醇或其衍生物通过管线B进入塔顶分布器与经管线C回流的纯甲缩醛混合后淋入塔中，使选用的脂肪醇或其衍生物从精馏塔的塔顶通过分布器均匀分布到填料中，脂肪醇或其衍生物在重力作用下沿填料表面向下流动，在此过程中，与上升过程中的含有杂质的汽化低浓度甲缩醛通过汽—液传质，将其中的杂质萃取，并流到塔底后收集在蒸馏釜中，经管线D去进行蒸馏进行脂肪醇或其衍生物的纯化处理，脱出其中的杂质，经管线B循环使用，精制的甲缩醛从塔顶经管线A采出，管线A上引出回流管线C。本发明对原料甲缩醛的初始浓度要求低、目标产物含量高、可以进行工业化生产。