本发明公开了一种连续生产着色聚酯的方法及设备，包括将聚合设备中聚合成的聚酯熔体通过主管道输入共混合装置、将有机或无机颜料粉体先加入助剂在气流粉粉碎机中进行粉碎和分散处理，然后与聚酯在混合器中混炼得色母粒、将色母粒加入共混合装置中共混处理，得着色聚酯。设备有粒子微加工设备与混合器连接，混合器和共混合装置连接，混合器通过主管道与连续聚合设备连接。本发明方法简单，设备结构合理，易操作，颜料成分分散均一，色泽鲜艳，品种稳定，生产的聚酯质量好，生产成本低。