本发明公开了一种中药复方膜分离制药技术，属于膜分离制药领域。它是先将中药复方水提取物合煎、粗滤后，根据分子量的大小选择不同孔径的膜，将药液通过由大到小不同孔径的膜，依次进行过滤，得到不同分子量段的提取物。经药效筛选，确定最佳有效分子量段。再经红外、高效液相定性定量而成。具有不丢失有效部位或成分、减少有效成分破坏、工艺相对简单、成本低、无污染的特点。克服了现有提取技术将长期临床验证和精心配伍的中药复方变成一个简单的几种化学成分组合的缺陷，从而保护了中医辨证论治进行组方的特色和物质基础，遵守了中医理论。可用于处理复杂中药复方，尤其适用于现行药品注册管理办法的中药复方五类新药的制备。