本实用新型公开了一种医疗废物微波处理装置，包括箱体、提升装置、粉碎机、输送装置、微波发生器、灭菌室、出料装置和控制面板，所述粉碎机和灭菌室之间设置有安全室，所述安全室底面设置有安全门，所述安全室的侧面设置有气体检测报警装置，所述出料装置的出料端设置有分拣装置，所述灭菌室内设置有灭火装置。本实用新型采用杀菌、毁形、易然气体检测报警、废物回收、尾气生物除臭等设施，对医疗废物进行综合处理，能避免有毒气体对人体的损害，减少环境的污染，操作简单，安全可靠，适用于大中型医院及各种医疗机构使用。