一种具有多层加密保护的存储装置，控制器[1]分别通过IDE接口[6]、flash接口[7]、排线与实时加密引擎[2]、存储硬盘[3]、flash模块[4]、指纹感应器[5]相连；控制器[1]通过USB接口[8]与计算机连接，对该存储装置进行安全有序地协调、管理及对存储的数据信息进行加、解密处理，即：在采用指纹识别技术的同时，对存入的数据采用动态密钥实时加、解密和bit级拆分存储；因此有效的防止了单独盗取存储硬盘并接入到其它存储单元控制板上来窃取内部数据的可能。使存储硬盘内的数据在多层加密保护下更加安全，本实用新型可广泛应用在对保密层次要求较高的公安、国防、金融、科研等行业和部门。