一种具有交替扫描的双扫描头的扫描装置，包含进纸匣、进纸通道、出纸通道、出纸匣、第一扫描头、第二扫描头及馈纸机构。进纸匣用来存放数个文件。进纸通道连接至进纸匣及出纸通道，而出纸匣连接至出纸通道。第一扫描头位于进纸通道上，用来扫描各文件的背面以输出背面图像信号。第二扫描头位于出纸通道上，用来扫描各文件的正面以输出正面图像信号。馈纸机构用来将各文件从进纸匣依序沿着进纸通道及出纸通道馈送至出纸匣。馈纸机构馈送各文件使各文件在进纸通道与出纸通道中的行进方向相反。