一种分子分离器其包括一外壳、一滤层、一滤网与一磁场提供片，外壳为中空并具有一进气端与一出气端，进气端设有一进气口，出气端设有一出气口；滤层一端结合于外壳的进气端内壁，滤层的内部空间相对于外壳的进气口；滤网环绕设置于滤层内部空间中；磁场提供片设置于滤层不与外壳结合的一端；本实用新型藉由磁场提供片因高温而产生的磁场作用下，油气分子经滤网裂解而生成无害的产物，而残余未反应的油气分子与脏污则由滤层吸附过滤，因此本实用新型可确实分离油气分子与空气，降低废气中的油气分子浓度，避免引擎的熄火与喘振。