本实用新型涉及基因生物技术领域，具体涉及一种高通量基因、蛋白分析仪。本实用新型要克服现有技术存在的检测结果不准确，不能对基因结构进行分析，也不能对病原微生物的蛋白分析检测的缺点。所采用的技术方案是：包括激发光滤光片组、激发光源、光电倍增管和样品盘，还包括发射光滤光片组、反射半透镜、激发光起偏器、发射光偏振片和液体光纤，所述样品盘的测量位上方设置有倾斜设置的反射半透镜，其反射面方向上垂直设置有激发光起偏器，激发光源的发光方向朝向激发光滤光片组，在激发光滤光片组与激发光起偏器之间设置有液体光纤；所述反射半透镜正上方依次设置有发射光偏振片、发射光滤光片组和光电倍增管。