本实用新型涉及一种刻度吸管自动清洗器。在清洗桶内置有一端位于桶内，另一端位于桶外的倒U形虹吸管，所述虹吸管的U形不对称设置，其长端位于桶外，清洗桶的下部有镂孔的隔板，清洗桶设置在超声波清洗机内，所述清洗桶底部与超声波清洗机的换能器相连接。本实用新型可以单独采用清洗桶清洗，具有自动进行、自动完成的功能；也可以将清洗桶与超声波清洗机相结合，达到进一步提高刻度吸管清洗洁净度和清洗效率的目的。