一种低温保存管自动化封管机结构改良，包括夹持座、旋转机构、加热机构、运送机构与壳体，并透过复数个控制单元，作为本实用新型的启闭操作；夹持座为一圆柱体状的本体，该本体下方延伸有一延伸部，以便与该旋转机构相结合；运送机构包含与该驱动马达相连结的线性滑轨，前述驱动马达及线性滑轨共同装置于机台上；加热机构设于运送机构一侧；控制单元以线路分别与旋转机构、运送机构及加热机构相连结；该壳体罩覆于运送机构及加热机构的外侧；本实用新型让冷冻保存处理前的封管作业，能够省时、省力，并使低温管外侧包覆的保护封膜保持一高品质的密封状态，避免发生液态氮渗入低温管的情况，以确保样品的保存品质与解冻时的安全。