本实用新型公开了一种印刷机电子轴控制系统。它包括一台用于采集各分机工作站套色误差数据并供用户监控的主机，所述主机外挂有彩色液晶触摸屏，并通过CAN总线与多个分机工作站连接，分机工作站设置有信号处理和电机相位调整功能模块，并与伺服电机和检测光眼相连接，检测光眼作为传感器，用于检测印品的套色误差，伺服电机作为调整电子轴相位偏差的执行机构。本实用新型结构设计合理，技术先进，自动化程度高，工作性能可靠，操作简便，维护便利，能够节省能源。