本实用新型公开了一种窝眼筒清选机，机架顶部的喂料斗下端出口处设有振动给料器，振动给料器的下方设有送料管，送料管出口伸入进料体内部，进料体与搅龙轴和窝眼筒之间连接，窝眼筒内设有V形分离槽，分离槽上设有固定轴，分离槽通过固定轴与支座连接，分离槽内又设有螺旋输送搅龙，螺旋输送搅龙固定在搅龙轴上，进料体通过三角皮带、皮带轮与电机连接，窝眼筒的右端设有接料口，V形分离槽的右端设有接料口，搅龙轴的右端支承在支座上，所述支座与机架相连接，机架右端设有尼龙托轮，尼龙托轮支承窝眼筒。采用上述的窝眼筒清选机，可利用窝眼筒有效清除种子里面的有害长杂或短杂，提高种子净度。还可按种子长度尺寸进行分级，得到质量等级不同的种子。