本实用新型涉及一种逆渗透净水器马达冷却结构，其主要包含有：一座体，并于其上设有一马达本体，该马达本体内具有一驱动装置及一电源装置，其中该驱动装置包含有以偏心运转的一凸轮组，及输出动力的一驱动组；一上盖组，设于该马达本体上方，其包含有一壳体，并具有一入水口及一出水口，一止逆阀装置设于该壳体内部；其中：一冷却装置，呈中空管状，设于该本体马达上，其预定部位分别设有一进水口及一排水口；通过上述构件，利用逆渗透净水器的废水由该进水口进入，再由该排水口排出，能降低马达因驱动时所产生的温度，同时可将废水再次使用，极符合环保效益，而且，其无需加装压力储水筒进而降低成本。