一种公共卫生应急指挥信息系统，其通过预建一个在处理各类突发事件时所需要的相关参考信息的应急信息资料库，当受理台受理及记录来报的突发事件后，GIS模块可定位该突发事件的发生地点并提供该发生地点周边地形的地图，然后根据所述突发事件自所述应急信息资料库内提取相关参考信息进行相应的调度当该突发事件被受理后，最后根据对所述突发事件的处理进程生成相应的进程报告，以实现对突发事件的高效处理，提高各职能部门的应急能力，最大程度降低突发事件对公众的影响。