本实用新型公开了一种低水头水能发电系统，属于水力发电系统，目的是解决目前不适宜筑坝安装中高水头发电机、占总长度99％以上的江河、湖泊的水力不能利用及拦河筑坝发电投资大、周期长的问题，包括设置在河流上的溢洪低坝，设置在溢洪低坝下游侧的水轮机，通过转轴与水轮机转动连接的发电机，所述溢洪低坝上设置有穿过其并与上游侧河水相通的导流槽，水轮机的进水口通过导流槽与溢洪低坝的上游侧河水相通，导流槽下侧设置有与其固定连接的固定支架。本实用新型适用于各种低水头的水域进行水力发电。