本实用新型公开了一种旋转式扩散荧光层析成像系统，包括半导体激光器、计算机、旋转工作台、步进电机和CCD相机。半导体激光器和半导体制冷盒分别固定在旋转工作台的二个水平臂上，CCD相机位于半导体制冷盒内；样品固定夹固定在支架上，并位于CCD相机与半导体激光器之间；步进电机带动CCD相机和半导体激光器以旋转工作台的竖直杆中心点为中心旋转；计算机向旋转工作台和CCD相机传送控制信号，接收CCD相机传送的图像数据，并对图像数据进行分析处理。本实用新型系统可以随意控制采集的数据量大小，提高成像效果；能够实现步进电机旋转与制冷电荷藕合相机拍摄控制协同工作。这样可以实现在系统旋转过程中，制冷电荷藕合相机能够稳定有效的采集数据。