本实用新型涉及一种生物控制加解密存储设备系统，包括具有通用串行总线接口的计算机、通用串行总线设备控制器、指纹识别加解密嵌入式系统芯片、外部存储设备、指纹传感器、人机交互模块，所述通用串行总线设备控制器与所述指纹识别加解密嵌入式系统芯片连接；所述指纹传感器与所述指纹识别加解密嵌入式系统芯片连接；所述外部存储设备与所述指纹识别加解密嵌入式芯片连接；所述通用串行总线设备控制器与所述具有通用串行总线接口的计算机相连；所述人机交互模块与所述指纹识别加解密嵌入式系统芯片连接。本实用新型能够提高指纹特征指提取和比对的速度，减少加解密所消耗的时间，能够快速地读取移动存储设备中的数据以及向该存储设备写入加密数据。