本实用新型公开了一种微型计算机的防水结构，包含至少一设有面板的机壳，该面板上具有多个穿孔；一设于机壳中的主机装置，该主机装置具有中央处理器、多个电子组件及储存单元，且主机装置设有多个与面板各穿孔对应的按键部及连接器；以及多个分别固设于各穿孔中且分别收置各按键部及连接器的防水单元，各防水单元的一端定位于面板的一面上并活动设有一盖体。这样，可使微型计算机具有防水效果，进而可适用于船上或水中，并使该微型计算机同时具有较好的散热功能。