本实用新型公开了一种微耕机传动箱输出轴密封结构，包括传动箱壳体，传动箱壳体设左、右安装耕刀的输出轴并用油封进行密封，在输出轴上设有套筒，套筒一端固定在传动箱壳体上，另一端延伸到输出轴上所安装的耕刀。套筒在油封位置设置内隔板，内隔板设输出轴孔与输出轴之间密封间隙配合。本实用新型由于在输出轴上设有套筒，套筒能将安装间距与外界隔离，灰尘、泥水、泥浆、泥砂等不易进入其间。同时套筒在油封位置设置内隔板，内隔板设输出轴孔与输出轴之间密封间隙配合，进而几乎不可能使泥浆等进入传动箱内部，保护油封的唇部不被磨损，从而使传动箱内的润滑油保持清洁。传动箱内的传动机构和油封不被灰尘、泥浆、泥砂磨损而寿命延长。