一种电机轴动态防水结构，包括端盖、穿过端盖中心轴孔的电机轴，以及套设在电机轴上的轴承，其特征在于电机轴在轴承的同一侧间隔地设置有两个油封，端盖在中心轴孔上分别对应地具有与油封进行端面定位的第一内肩、第二内肩，电机轴、油封和端盖中心轴孔的内壁之间形成一个注满有非液态、非亲水性润滑脂的封闭的环形腔室。本实用新型的电机轴采用了单边双油封结构，在电机轴和端盖通孔之间形成一个全密封的腔室，腔室内注满非液态、非亲水性润滑脂，当在电机轴受到外力冲击而发生径向瞬间移动的时候，密封腔室内因为始终被润滑脂填满，从而能够有效地起到防水并保护电机的作用。