本实用新型涉及一种多腔室连续水浴灭菌器，属于制药装备，用于玻璃瓶装、塑料瓶装、塑料袋装液体类制品的高温灭菌，灭菌腔室内设有喷淋喷头，灭菌腔室连通通气管，其灭菌腔室为隧道式腔室，前端设有进车口，后端设有出车口，进车口和出车口分别配装密封门，灭菌腔室从前端到后端依次分为前压力平衡腔室、工作腔室和后压力平衡腔室，前压力平衡腔室、工作腔室和后压力平衡腔室间分别设有平移密封门，工作腔室从前到后依次分为升温区、灭菌区和冷却区，灭菌腔室的底部设有灭菌车传送装置。结构简单，操作方便，采用隧道式腔室，可实现连续作业，周期短，工作效率高，并且，无需不断地对灭菌水介质进行循环加热、冷却，能耗低，特别适合大批量生产的企业。