本实用新型提供的籽棉异性纤维清理机，涉及一种棉花加工设备。它至少包括卸料装置、长异纤清理装置、短异纤清理装置和异纤回收装置，卸料装置联接于长异纤清理装置的进料口，长异纤清理装置的出料口联接于短异纤清理装置的进料口，短异纤清理装置的异纤出料口与异纤回收装置联接。长异纤清理装置可选用立式多辊异纤棒条机；短异纤清理装置至少包括风机、换风室、悬浮箱、扩散箱，风机与换风室通过风道联接，换风室、悬浮箱、扩散箱由低到高依次迭加设置并固定联接，扩散箱的中部设有籽棉进料口，扩散箱的顶端为异纤出料口，悬浮箱的侧壁上开有籽棉出料口。本实用新型具有清理效果好，成本低的优点。