本实用新型涉及一种组合式双头自动玻璃钻孔机结构，特征是玻璃钻孔机安装固定在机座的一端上，线性导轨固定在机座上，滚珠滑块系在线性导轨上，蜗轮减速机固定在机座另一端上，滚珠丝杆的一端与蜗轮减速机输出轴连接，另一端与支座连接，系在滚珠丝杆上的滚珠螺母与玻璃钻孔机连接，钻孔机安装在滚珠滑块上，编码器安装在蜗轮减速机输出轴上，数字式显示控制器安装在玻璃钻孔机左上侧，通过导线分别与电机、编码器连接。本实用新型移动平稳，移动距离正确，保证了孔距的尺寸精度；两孔可同时钻，操作者只须搬一次，不但孔距正确，而且钻孔效率可提高一倍；能使操作者正确操作，操作简易便利，在一定范围内，可选择任何所需的孔距尺寸。