本实用新型涉及一种菜椒籽皮分离机。包括进料箱、机体、接皮箱、接籽箱、脚轮及机械传动装置，其机体顶部设置有进料箱，底部设置有脚轮，机体前部设置有接皮箱，中部设置有接籽箱，机体内安装有机械传动装置，所述的机械传动装置包括下层刀组传动部分、上层刀组传动部分、万向传动部分、滚动筛传动部分，其下层刀组传动部分链接上层刀组传动部分，上层刀组传动部分链接万向传动部分，万向传动部分链接滚动筛传动部分；采用双层交叉刀组及搓板进行二次切料及搓皮将菜椒的皮、籽分离，可有效提高椒籽完全收取率；只需一次完全取籽，可节省大量人力，省工省时，降低生产成本；速度快，工效高。