本实用新型涉及一种主动跟动加载结构试验系统，包括承载框架、水平加载作动器、垂向加载作动器，所述试样分别连接垂向微动探测装置和水平微动探测装置；所述水平加载作动器侧方设有垂向伺服跟动作动器，所述垂向加载作动器侧方设有水平伺服跟动作动器，所述垂向微动探测装置、垂向伺服跟动作动器、水平微动探测装置、水平伺服跟动作动器分别连接计算机控制系统。本实用新型可以保证垂向试验力在试验过程中始终保持在垂直状态，从而不受被测试样水平变形的影响；以及保证水平试验力在试验过程中始终保持水平状态，从而不受被测试样垂向变形的影响。