本实用新型公开一种病理蜡屑自动收集器，包括蜡屑收集口、与该蜡屑收集口连接的蜡屑存储器以及连接该蜡屑存储器的吸尘器。其中，蜡屑收集口设置有进屑口和出屑口，且在进屑口两侧端面位置处分别装设有强磁体，以使得该蜡屑收集口吸附于病理蜡屑切片机的刀片架上；蜡屑存储器包括一呈贯通状的外壳、装设于该外壳内腔中的滤网、装设于该滤网内的滤芯、连接于蜡屑收集口的进口管接口及将该进口管接口装设于外壳的压盖；吸尘器设有脚踏开关，且踏动该开关可使得蜡屑收集口处产生负压，从而将蜡屑收集于蜡屑存储器中。本实用新型的优点在于可自动收集蜡屑，且采用一次性滤纸杯，干净卫生且方便处理，及采用磁性吸附方式，避免对病理蜡片机做任何改动。