本实用新型涉及一种指纹加密证书及证卡防伪系统，包括条形码载体、制证单元、验证单元，所述制证单元由指纹扫描仪、私钥加密机、制证PC机、打印输出装置组成，所述验证单元包括条码识读装置、公钥解密机、指纹扫描仪、验证PC机，所述制证PC机分别连接外部的指纹扫描仪、私钥加密机、打印输出装置，所述验证PC机分别连接外部的条码识读装置、指纹扫描仪、公钥解密机。制证与验证操作便捷、系统运行费用低廉，有效地解决了证书、证卡造假问题并避免了由此带来的损失；可实现证书或证卡与注册登记人唯一的对应关系(即满足人证同一性)，使得证书或证卡的注册登记人(即真正持有者)必须亲自到场才可验证通过，提高了安全水平。