使用微胶囊载体的内循环生物流化床反应器，含有床体、升流管、导流管、隔离管、布气布水装置，床体分为上筒体、下筒体和倒锥形筒体，上筒体的上口处有出水槽，下筒体上有进水口和取样口，下筒体底部安装了布气布水装置和载体排出口；升流管为两端敝开的直管，置于下筒体的内腔；床体内腔上部有导流管，导流管分为上导流管、下导流管和锥形管，下导流管罩在升流管的上部；上导流管的外侧有隔离管，隔离管的下口与锥形管的上口连接，锥形管下口与倒锥形管上口连接，倒锥形管管壁与连接上筒体和下筒体的锥形筒体筒壁形成载体回流槽。本实用新型使用方便，操作简单，便于实际使用过程中实现不同规模与不同应用目标的系统优化和放大设计。