本实用新型涉及一种离心机转子识别控制系统，包括控制器、至少一转子检测元件、用于非接触检测转子检测元件的转子检测器、至少一电机检测元件、及用于非接触检测电机检测元件的电机检测器，控制器包括控制中心、电路控制模块和电机转速控制模块，控制中心分别电连通转子检测器、电机检测器、电路控制模块和电机转速控制模块，转子检测器和电机检测器是霍尔传感器，转子检测元件和电机检测元件是磁体，还可以包括报警元件、输入设置元件和显示元件，控制中心电连通报警元件、输入设置元件和显示元件，本实用新型能自动识别转子规格，并自动控制最高转速，超过最高转速时切断电源，提高了离心机使用的安全性。