一种多塔式粉料臭氧灭菌系统，其特征是它包括：送风装置、臭氧发生器、第一气粉混合主塔和第二气粉混合主塔，第一气粉混合主塔和第二气粉混合主塔之间连接有使两个塔内交替产生正压和负压的吸风管及回风管，所述的送风装置串接在送风管和回风管之间，在所述的第一气粉主塔和第二气粉主塔之间还连接有将一个塔中的粉料送入另一个塔中的送粉管道和回粉管道，且一个主塔的送粉管道与另一个主塔的回料管道相通；在所述的第一气粉混合主塔和一个第二气粉混合主塔的下部均设有气料分配器，在塔的顶部均安装有使每个主塔上的吸风管与回风管与装有粉料的塔腔不直接相通，以保证吸风管或回风管中不含粉料的气粉过滤器。本实用新型具有结构简单，灭菌效果好，节能环保、用途广的优点。