本实用新型的基于热管散热器的基因扩增仪，包括自上而下依次装置的可插放若干试管的变温金属模块，半导体制冷器和散热器，其特征是散热器包括热管和铜块，热管埋入铜块中，其两端伸出铜块，在热管的一个或两个伸出端连接散热翅片，热管内有液体工质。基因扩增仪采用热管散热器，利用热管散热器内部的液体冷却介质可以将集中在半导体制冷器底部小面积内的热量传导到远处，在远处利用其扩大面积的翅片散热，并可以使用强制风冷措施来获得更大的散热能力。使半导体制冷器热面温度差别变小，温度降低，提高了制冷器效率；变温金属模块温度均匀性得到改善，适用试剂品种扩大。