本实用新型公开了一种与荧光显微镜配合使用的细胞灌流装置，其包括蠕动泵、荧光显微镜、控温器、封有细胞的小室、至少两个灌流液储存管、至少两个铁架台以及至少两个电热加热套；所述的封有细胞的小室置于荧光显微镜的载物台上，小室的出液口通过连接管与蠕动泵连接；所述灌流液储存管由固定器固定于铁架台上，灌流液储存管通过连接管与小室的进液口连接；灌流液储存管外套有电热加热套，所述的电热加热套与控温器连接。该装置取材及组装方便，在实验需要进行组装即可；细胞灌流效果好；应用方便，持久耐用；结构简单，性能稳定；低消耗，低成本；系统各部件可随时更换。