本发明公开了一种环境监测实验室管理信息系统及其操作方法，计划管理平台维护环境监测任务计划；任务生成装置获取环境监测任务计划生成包括样品采集子任务和样品分析子任务的环境监测任务；标签生成装置为样品采集子任务需采集的各样品分别生成样品识别标签；任务派发装置将环境监测任务的样品采集子任务和样品分析子任务分别下发给采样平台和分析平台；采样平台根据样品采集子任务在现场进行采样，将样品与对应的样品识别标签绑定；样品管理平台基于样品识别标签完成样品交接；分析平台从样品管理平台取样并根据对应的样品分析子任务对样品进行分析得到分析数据反馈给执行结果处理平台；执行结果处理平台对所述任务分析结果进行相应的处理。