本发明公开了一种化学药剂投入生产使用是否影响污水厌氧处理系统正常运行的判定方法及使用的厌氧反应装置。所述的该厌氧反应装置包括厌氧反应容器、振荡器、气体收集容器和承载容器，所述的厌氧反应容器置于振荡器上，所述的气体收集容器和承载容器中均盛满液体，且气体收集容器呈开口朝下的状态置于所述的承载容器中，此时的气体收集容器处于液体密封状态，所述的厌氧反应容器和气体收集容器之间通过管路连通。所述的判定方法通过模拟厌氧环境，在厌氧反应装置中设置相同的厌氧泥量、污水水质水量、外在环境下添加等同生产排放浓度的化学药剂(并做空白)进行测试，通过与空白比较测试后CODcr去除率、产气量以判定化学药剂对厌氧菌是否有毒性。