使用分级反向索引表的DNA比对
授权
摘要
用于构建可用于将检索序列与参考数据匹配的分级索引表的系统和方法。所述索引表可经构建以含有与给定长度的所有子序列的穷尽性列表相关联的条目,其中每个条目含有在所述参考数据中的每个子序列的匹配的数量和位置。可以迭代方式构建所述分级索引表,其中基于匹配的数量大于一组相应阈值中的每一个,选择性地和迭代地构建用于每个延长子序列的条目。所述分级索引表可用于搜索在检索序列和参考数据之间的匹配,并且对每个相应候选匹配执行错配鉴别和表征。
基本信息
专利标题 :
使用分级反向索引表的DNA比对
专利标题(英):
暂无
公开(公告)号 :
CN108140071A
申请号 :
CN201680061446.2
公开(公告)日 :
2018-06-08
申请日 :
2016-10-21
授权号 :
CN108140071B
授权日 :
2022-04-29
发明人 :
M·B·多尔J·D·加玛尼S·V·伍德D·G·阿拉斯塔斯M·A·亨特
申请人 :
相干逻辑公司
申请人地址 :
美国得克萨斯
代理机构 :
中国国际贸易促进委员会专利商标事务所
代理人 :
鲍进
优先权 :
CN201680061446.2
主分类号 :
G06F19/24
IPC分类号 :
G06F19/24 G06F19/18
法律状态
2022-04-29 :
授权
2018-11-16 :
实质审查的生效
IPC(主分类) : G06F 19/24
申请日 : 20161021
申请日 : 20161021
2018-06-08 :
公开
注:本法律状态信息仅供参考,即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
文件下载
暂无PDF文件可下载