本发明提供一种自动包装物料配重系统及配重方法，包括物料配重输送线及控制系统，其特点是：物料配重输送线包括平行排列的主输送线和副输送线，主输送线包括主进料段输送带、主称重段输送带、配重段输送带及配重辅助段输送带，副输送线包括副进料段输送带、副称重段输送带，在主输送线与副输送线之间设置配重缓冲装置，在副称重段输送带上方设置入栈推送装置，在配重缓冲装置同一侧设置出栈推送装置，控制系统包括主输送线控制模块、副输送线控制模块、物料推送控制模块及物料称重配重算法模块。应用于自动包装生产线，作为配重环节，可提高生产效率和配重的准确率，减轻劳动强度，同时还便于统计和反馈物料的重量数据。