本发明提供了一种机卡绑定关系认证方法、装置以及通信系统，其中的方法包括：获取用户预先申请保存的预置机卡绑定关系，从终端自注册平台获取用户的当前机卡绑定关系，根据预置机卡绑定关系和当前机卡绑定关系的比对结果确定认证结果，通过用户自主申请保存机卡绑定关系，在进行业务时将保存的机卡绑定关系与当前的机卡绑定关系进行比对，根据比对结果判断是否给予用户提供相应的服务。本发明的机卡绑定关系认证方法、装置以及通信系统，能够协助应用在无法获取机卡关系信息的前提下，实现下发密码短信等的安全，可以保障用户的帐号与信息安全，避免出现手机号码盗用的情况，从而避免以手机号码作为帐号的应用出现帐号密码的安全性问题。