提供了用于识别和筛选氢键网络的方法和装置。计算设备可以确定与一个或多个分子相关的氢键网络的检索空间，其中检索空间可以包括与涉及氢键网络的多个残基相关的多个能量项。计算设备可以检索该检索空间以基于多个能量项识别一个或多个氢键网络。计算设备可以基于所识别的氢键网络的分数来筛选所识别的氢键网络以识别一个或多个筛选的氢键网络。可以生成与一个或多个筛选的氢键网络相关的输出。还提供了可以形成具有模块化氢键网络介导的特异性的同型寡聚体的多肽。